Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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