Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms