Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTROBQ8N137 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTROBQ8N137 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms