Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LRRC9Q6ZRR7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LRRC9Q6ZRR7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms