Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms