Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CARMIL1Q5VZK9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms