Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP6Q5VW22 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms