Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF20Q5VT98 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms