Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RSPH4AQ5TD94 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms