Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA8Q53HL2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms