Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PROX2Q3B8N5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PROX2Q3B8N5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms