Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms