Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGSM1Q2NKQ1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGSM1Q2NKQ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms