Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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