Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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