Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms