Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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