Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA6Q16445 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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