Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP4Q15650 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP4Q15650 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms