Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms