Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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