Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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