Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTB1Q13884 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms