Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALCAMQ13740 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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