Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3B2Q13367 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B2Q13367 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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