Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK3Q13003 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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