Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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