Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CNTN1Q12860 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CNTN1Q12860 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CNTN1Q12860 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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