Protein–RNA interactions for Protein: Q12472

TY2B-DR1, Transposon Ty2-DR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-DR1Q12472 RPL9BYNL067W 576 nt0.03□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 FMP23YBR047W 528 nt0.03□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 MLP1YKR095W 5628 nt0.03□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 TOF2YKR010C 2316 nt0.03□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 CYC7YEL039C 342 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YHR212CYHR212C 336 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 VPS25YJR102C 609 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 RCN1YKL159C 636 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YAR060CYAR060C 336 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 PGA1YNL158W 597 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 ECM25YJL201W 1800 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 SPT21YMR179W 2277 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 PCL2YDL127W 927 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YGL039WYGL039W 1047 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 POP8YBL018C 402 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 NDD1YOR372C 1665 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YDL196WYDL196W 330 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 SWF1YDR126W 1011 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 VPS74YDR372C 1038 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YNL089CYNL089C 477 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 RRT16YNL105W 429 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 NOP12YOL041C 1380 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YLR225CYLR225C 1224 nt0□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 DBP6YNR038W 1890 nt-0□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YGR045CYGR045C 363 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YIM2YMR151W 438 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 RAD10YML095C 633 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 PEX15YOL044W 1152 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 PIG1YLR273C 1947 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 BRX1YOL077C 876 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YPL034WYPL034W 498 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 MFA1YDR461W 111 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YGR219WYGR219W 342 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 YBR012CYBR012C 420 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 MKT1YNL085W 2493 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY2B-DR1Q12472 SPO12YHR152W 522 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 NUR1YDL089W 1455 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YJL007CYJL007C 315 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YLR042CYLR042C 486 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 RPL37AYLR185W 267 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 NUT2YPR168W 474 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 AME1YBR211C 975 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 SLI15YBR156C 2097 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 TAP42YMR028W 1101 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YBR224WYBR224W 516 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 SLM6YBR266C 453 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 OSH6YKR003W 1347 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 RPC25YKL144C 639 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YBL094CYBL094C 333 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 IZH4YOL101C 939 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 MUD2YKL074C 1584 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 RPL35BYDL136W 363 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 RPL35AYDL191W 363 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 COG7YGL005C 840 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 snR190snR190 190 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YCR043CYCR043C 384 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 ALG13YGL047W 609 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YGR164WYGR164W 336 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt-0.1□□□□□ -2.42
TY2B-DR1Q12472 TMA20YER007C-A 546 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 MVB12YGR206W 306 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 HYM1YKL189W 1200 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 ROX1YPR065W 1107 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 SLS1YLR139C 1932 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 MPT5YGL178W 2580 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YDR509WYDR509W 348 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 IMP3YHR148W 552 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YJR071WYJR071W 369 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YLR031WYLR031W 561 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YOR282WYOR282W 321 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 SWI5YDR146C 2130 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YLR458WYLR458W 381 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 MAM1YER106W 909 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 COX3Q0275 810 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 DLT1YMR126C 1029 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 TRS20YBR254C 528 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 BNS1YGR230W 414 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 SDH2YLL041C 801 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YOR199WYOR199W 330 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 PRP5YBR237W 2550 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YPD1YDL235C 504 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 CGI121YML036W 546 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 ATP18YML081C-A 180 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 YPR153WYPR153W 423 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 VPS52YDR484W 1926 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY2B-DR1Q12472 SST2YLR452C 2097 nt-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.2 ms