Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YPL182CYPL182C 384 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 PEP3YLR148W 2757 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 SET2YJL168C 2202 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 GRR1YJR090C 3456 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 STB4YMR019W 2850 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 CSF1YLR087C 8877 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 QCR7YDR529C 384 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YLR334CYLR334C 381 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 SLM1YIL105C 2061 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 IST2YBR086C 2841 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YJR098CYJR098C 1971 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YPR097WYPR097W 3222 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 SEC31YDL195W 3822 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 RPS24AYER074W 408 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 HOP2YGL033W 657 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YOR146WYOR146W 306 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE4Q12455 YDR341CYDR341C 1824 nt2.09□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 NAM7YMR080C 2916 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 NOP14YDL148C 2433 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 TOF1YNL273W 3717 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 FKS1YLR342W 5631 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RBK1YCR036W 1002 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RTT102YGR275W 474 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 BSC3YLR465C 309 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YPL238CYPL238C 390 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 LYS9YNR050C 1341 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RUD3YOR216C 1455 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 GNT1YOR320C 1476 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 KOG1YHR186C 4674 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 HSK3YKL138C-A 210 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YLR053CYLR053C 327 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 UBC7YMR022W 498 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YPR099CYPR099C 357 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 ZRG8YER033C 3231 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 HER1YOR227W 3741 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RTT107YHR154W 3213 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 NEO1YIL048W 3456 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RPH1YER169W 2391 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YDL062WYDL062W 426 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YGL239CYGL239C 315 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YAR047CYAR047C 321 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 PGA1YNL158W 597 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YBL083CYBL083C 426 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YBL108WYBL108W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 SEF1YBL066C 3447 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 VPS8YAL002W 3825 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 TOF2YKR010C 2316 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YDL118WYDL118W 381 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 VTC1YER072W 390 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RPS27AYKL156W 249 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YLR434CYLR434C 384 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 SYH1YPL105C 2550 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 TOR2YKL203C 7425 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RPL37BYDR500C 267 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 BRP1YGL007W 378 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 PAN3YKL025C 2040 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YBL012CYBL012C 402 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 RPL9BYNL067W 576 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YOR029WYOR029W 336 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YPL261CYPL261C 309 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE4Q12455 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YDL011CYDL011C 324 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YDL152WYDL152W 366 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 CYB5YNL111C 363 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 CAT2YML042W 2013 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YCR043CYCR043C 384 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 UBP1YDL122W 2430 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 TFC8YPL007C 1767 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YER172C-AYER172C-A 381 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 TIM13YGR181W 318 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 RPL42BYHR141C 321 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 HIT1YJR055W 495 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 RPL42AYNL162W 321 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 NUP120YKL057C 3114 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 CHC1YGL206C 4962 nt2□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 DIS3YOL021C 3006 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 GIM4YEL003W 336 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 ATP7YKL016C 525 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YOR121CYOR121C 306 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 PCF11YDR228C 1881 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 DFG16YOR030W 1860 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 AIM9YER080W 1884 nt1.97□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.97□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.97□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 CGI121YML036W 546 nt1.97□□□□□ -2.09
SPE4Q12455 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.6 ms