Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 SMC3YJL074C 3693 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 YBR174CYBR174C 315 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 ANB1YJR047C 474 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 RPS12YOR369C 432 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 MSC6YOR354C 2079 nt3.21□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 RAD4YER162C 2265 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 snR76snR76 109 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YLR282CYLR282C 342 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 PHM6YDR281C 315 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YBL012CYBL012C 402 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YPR022CYPR022C 3402 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YDL196WYDL196W 330 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 PFF1YBR074W 2931 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 PSY2YNL201C 2577 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 ATG13YPR185W 2217 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YNL211CYNL211C 261 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 PEP3YLR148W 2757 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 SPA2YLL021W 4401 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 RPH1YER169W 2391 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 IKI3YLR384C 4050 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 INP52YNL106C 3552 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 PHD1YKL043W 1101 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YPR089WYPR089W 2667 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 RTT10YPL183C 3042 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 SYT1YPR095C 3681 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 FIG4YNL325C 2640 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YAT2YER024W 2772 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 RFX1YLR176C 2436 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 RAD2YGR258C 3096 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 HAL9YOL089C 3093 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 PKH1YDR490C 2301 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YNR065CYNR065C 3351 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1A-DR3Q12441 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RGM1YMR182C 636 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 CMC4YMR194C-B 222 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YBR277CYBR277C 402 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RIC1YLR039C 3171 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 KAP123YER110C 3342 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 FLO9YAL063C 3969 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 ROG1YGL144C 2058 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 AIM44YPL158C 2277 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 SPO75YLL005C 2607 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 NIP100YPL174C 2607 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YFR016CYFR016C 3702 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YEL025CYEL025C 3567 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 SRP14YDL092W 441 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 PAA1YDR071C 576 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 EMP24YGL200C 612 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RPL22AYLR061W 366 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YNL114CYNL114C 372 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RRP12YPL012W 3687 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 ZRG17YNR039C 1818 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 ZDS2YML109W 2829 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 MIT1YEL007W 2001 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 ATG26YLR189C 3597 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 DAN4YJR151C 3486 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RTC1YOL138C 4026 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 PBY1YBR094W 2262 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 GLC3YEL011W 2115 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 UBP14YBR058C 2346 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RPL42BYHR141C 321 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RPL42AYNL162W 321 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 AHC1YOR023C 1701 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RAD5YLR032W 3510 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 TSC11YER093C 4293 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 FMP16YDR070C 282 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RPL23BYER117W 414 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RPS21AYKR057W 264 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 EDS1YBR033W 2760 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 UTP14YML093W 2700 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 SPC98YNL126W 2541 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 OST4YDL232W 111 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 TMA19YKL056C 504 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YPL044CYPL044C 549 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YMR317WYMR317W 3423 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 DNL4YOR005C 2835 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YCR043CYCR043C 384 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RPS25BYLR333C 327 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YBR206WYBR206W 324 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 SUL1YBR294W 2580 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 CTF4YPR135W 2784 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 SWI5YDR146C 2130 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 MET5YJR137C 4329 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 MNL2YLR057W 2550 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 PDR12YPL058C 4536 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 SCH9YHR205W 2475 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 RPN1YHR027C 2982 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 NOP10YHR072W-A 177 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 YPL278CYPL278C 303 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-DR3Q12441 SPC105YGL093W 2754 nt3.09□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt3.08□□□□□ -1.92
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