Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 YMR324CYMR324C 243 nt2.04□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 ROX1YPR065W 1107 nt2.04□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 VPS35YJL154C 2835 nt2.04□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 DNF3YMR162C 4971 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 YDL068WYDL068W 330 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 SEN15YMR059W 387 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 TSC3YBR058C-A 243 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.03□□□□□ -2.08
SNU66Q12420 YNL144CYNL144C 2223 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 PPN1YDR452W 2025 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 ADR1YDR216W 3972 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 SFB2YNL049C 2631 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 MNL2YLR057W 2550 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 HUR1YGL168W 333 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YLR101CYLR101C 396 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 COA6YMR244C-A 315 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 PGA1YNL158W 597 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 snR54snR54 86 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 ZRG8YER033C 3231 nt2.02□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 NUP192YJL039C 5052 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 VPS52YDR484W 1926 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 NOP53YPL146C 1368 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YGR025WYGR025W 303 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 NBL1YHR199C-A 222 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 PRM3YPL192C 402 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 SAR1YPL218W 573 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YPR039WYPR039W 336 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 GPX2YBR244W 489 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 SLM6YBR266C 453 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 CHC1YGL206C 4962 nt2.01□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 HSL1YKL101W 4557 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 IRC20YLR247C 4671 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YDL041WYDL041W 354 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YHL037CYHL037C 402 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YHR125WYHR125W 306 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YKL202WYKL202W 582 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 BPH1YCR032W 6504 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 GCN2YDR283C 4980 nt2□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YFL019CYFL019C 354 nt1.99□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.99□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.99□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 snR13snR13 124 nt1.99□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 IRC10YOL015W 1761 nt1.99□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 RTP1YMR185W 2946 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 LRE1YCL051W 1752 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 MSH6YDR097C 3729 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YDR114CYDR114C 303 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YGL069CYGL069C 465 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 LSO2YGR169C-A 279 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YNL324WYNL324W 396 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YBR032WYBR032W 303 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 IRE1YHR079C 3348 nt1.98□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 VMR1YHL035C 4779 nt1.97□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 LYS9YNR050C 1341 nt1.97□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 PLC1YPL268W 2610 nt1.97□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 RBK1YCR036W 1002 nt1.97□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 YER135CYER135C 393 nt1.97□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 RTC6YPL183W-A 282 nt1.97□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 SWT1YOR166C 1377 nt1.97□□□□□ -2.09
SNU66Q12420 SLM1YIL105C 2061 nt1.96□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 snR79snR79 84 nt1.96□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 IES5YER092W 378 nt1.96□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 HSK3YKL138C-A 210 nt1.96□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 SNF5YBR289W 2718 nt1.96□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 SGD1YLR336C 2700 nt1.95□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.95□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YAR068WYAR068W 486 nt1.95□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YOR019WYOR019W 2193 nt1.95□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 DAS1YJL149W 1992 nt1.94□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 SMY1YKL079W 1971 nt1.94□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YHR210CYHR210C 1026 nt1.94□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 NFU1YKL040C 771 nt1.94□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 SEC22YLR268W 645 nt1.94□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 COX1Q0045 1605 nt1.94□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YOR146WYOR146W 306 nt1.93□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YLR149CYLR149C 2193 nt1.93□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 MEC1YBR136W 7107 nt1.93□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 KAR3YPR141C 2190 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YSW1YBR148W 1830 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 CDC24YAL041W 2565 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 AGA2YGL032C 264 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 ZEO1YOL109W 342 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 LEE1YPL054W 906 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 YPR146CYPR146C 330 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 CTR9YOL145C 3234 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 FRK1YPL141C 2598 nt1.92□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 CTF4YPR135W 2784 nt1.91□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 NOT5YPR072W 1683 nt1.9□□□□□ -2.1
SNU66Q12420 ATP17YDR377W 306 nt1.9□□□□□ -2.11
SNU66Q12420 YER079WYER079W 633 nt1.9□□□□□ -2.11
SNU66Q12420 YKL063CYKL063C 504 nt1.9□□□□□ -2.11
SNU66Q12420 CDC31YOR257W 486 nt1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 107.1 ms