Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 ACM1YPL267W 630 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 SYT1YPR095C 3681 nt3.03□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YAK1YJL141C 2424 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 COY1YKL179C 2040 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 VPS34YLR240W 2628 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 GLC3YEL011W 2115 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 NAB3YPL190C 2409 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 RSN1YMR266W 2862 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YLR149CYLR149C 2193 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 SIR3YLR442C 2937 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 ELG1YOR144C 2376 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 ORC1YML065W 2745 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 SAK1YER129W 3429 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 NPR3YHL023C 3441 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 RPL6AYML073C 531 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YOR102WYOR102W 351 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 EPL1YFL024C 2499 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 GRR1YJR090C 3456 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 DIA2YOR080W 2199 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 SBH1YER087C-B 249 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 VPS35YJL154C 2835 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 snR61snR61 90 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 EMC6YLL014W 327 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 RPL22AYLR061W 366 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YBR099CYBR099C 384 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 REC8YPR007C 2043 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YDR341CYDR341C 1824 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 CSR2YPR030W 3366 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 CIN8YEL061C 3003 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 PXA2YKL188C 2562 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 SEF1YBL066C 3447 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 FLO9YAL063C 3969 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 RPB10YOR210W 213 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 POL2YNL262W 6669 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 MDV1YJL112W 2145 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1A-NL1Q12391 STE23YLR389C 3084 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YGR050CYGR050C 357 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 HYP2YEL034W 474 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YSP2YDR326C 4317 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 UBP11YKR098C 2154 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 RAD4YER162C 2265 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 PFF1YBR074W 2931 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 AI2Q0055 2565 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 COP1YDL145C 3606 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 SNF5YBR289W 2718 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 snR43snR43 209 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 CHO2YGR157W 2610 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 SWI6YLR182W 2412 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YAT2YER024W 2772 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 MET5YJR137C 4329 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 RPS12YOR369C 432 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YBR174CYBR174C 315 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 SMY1YKL079W 1971 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 NCA2YPR155C 1851 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 RGM1YMR182C 636 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 RLM1YPL089C 2031 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 RRP12YPL012W 3687 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 KSP1YHR082C 3090 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-NL1Q12391 CHS2YBR038W 2892 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 snR76snR76 109 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YDL196WYDL196W 330 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 SPO75YLL005C 2607 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YHR080CYHR080C 4038 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 PEP3YLR148W 2757 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YMR317WYMR317W 3423 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RSF2YJR127C 4143 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 PSY2YNL201C 2577 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 DRS2YAL026C 4068 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RPL23BYER117W 414 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RPH1YER169W 2391 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 MSC6YOR354C 2079 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 NIP100YPL174C 2607 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RPS28BYLR264W 204 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YBL012CYBL012C 402 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YIL080WYIL080W 4722 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 SPC98YNL126W 2541 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 ATG13YPR185W 2217 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 SLY1YDR189W 2001 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 GIS1YDR096W 2685 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YPR089WYPR089W 2667 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RPL42BYHR141C 321 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YNL114CYNL114C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RPL42AYNL162W 321 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RCY1YJL204C 2523 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YTA7YGR270W 4140 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RFX1YLR176C 2436 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 ROG1YGL144C 2058 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RPN1YHR027C 2982 nt2.85□□□□□ -1.95
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