Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 VMA9YCL005W-A 222 nt4.28□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 PSK2YOL045W 3306 nt4.28□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt4.27□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 URA2YJL130C 6645 nt4.27□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YER039C-AYER039C-A 219 nt4.26□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt4.26□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 OSH3YHR073W 2991 nt4.26□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 EMC6YLL014W 327 nt4.26□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 SOK1YDR006C 2706 nt4.25□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 ELG1YOR144C 2376 nt4.25□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 MPH1YIR002C 2982 nt4.25□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 GRX8YLR364W 330 nt4.24□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 NUP120YKL057C 3114 nt4.24□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 NUP159YIL115C 4383 nt4.24□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YLR149CYLR149C 2193 nt4.23□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 VPS34YLR240W 2628 nt4.23□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt4.23□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 RSN1YMR266W 2862 nt4.22□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 BOI1YBL085W 2943 nt4.22□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 PHO81YGR233C 3537 nt4.22□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 CHS3YBR023C 3498 nt4.22□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 RPN2YIL075C 2838 nt4.22□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt4.21□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt4.21□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt4.21□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt4.21□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt4.21□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YCL019WYCL019W 5313 nt4.21□□□□□ -1.73
NOP53Q12080 YGR050CYGR050C 357 nt4.21□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt4.2□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 GRR1YJR090C 3456 nt4.19□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 RPB10YOR210W 213 nt4.19□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt4.19□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 PXA2YKL188C 2562 nt4.19□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 PFF1YBR074W 2931 nt4.18□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 HYP2YEL034W 474 nt4.18□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 NAB3YPL190C 2409 nt4.18□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 YLR282CYLR282C 342 nt4.17□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 TAO3YIL129C 7131 nt4.17□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 VPS3YDR495C 3036 nt4.16□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 MYO5YMR109W 3660 nt4.16□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 ZDS2YML109W 2829 nt4.16□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 YDL196WYDL196W 330 nt4.16□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 PAA1YDR071C 576 nt4.16□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 SAK1YER129W 3429 nt4.16□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 VPS35YJL154C 2835 nt4.16□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 KAP95YLR347C 2586 nt4.15□□□□□ -1.74
NOP53Q12080 YIL080WYIL080W 4722 nt4.15□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt4.15□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 YBR174CYBR174C 315 nt4.15□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 YBR277CYBR277C 402 nt4.15□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.14□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.14□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 NPR3YHL023C 3441 nt4.13□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 SEF1YBL066C 3447 nt4.13□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 ORC1YML065W 2745 nt4.13□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 SQS1YNL224C 2304 nt4.12□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 NCA2YPR155C 1851 nt4.12□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt4.12□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 YNL211CYNL211C 261 nt4.12□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 SPO75YLL005C 2607 nt4.12□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 SMC3YJL074C 3693 nt4.12□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 SIZ1YDR409W 2715 nt4.12□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 ZRG17YNR039C 1818 nt4.11□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt4.11□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt4.11□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt4.11□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt4.11□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 AI2Q0055 2565 nt4.11□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 SKP2YNL311C 2292 nt4.11□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 ARO1YDR127W 4767 nt4.1□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 RPS8AYBL072C 603 nt4.1□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 SPC98YNL126W 2541 nt4.1□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 DIA2YOR080W 2199 nt4.09□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 EMP24YGL200C 612 nt4.09□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 ANB1YJR047C 474 nt4.09□□□□□ -1.75
NOP53Q12080 AHC1YOR023C 1701 nt4.09□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 STU1YBL034C 4542 nt4.09□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 HAL9YOL089C 3093 nt4.08□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 RRP12YPL012W 3687 nt4.08□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt4.08□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 MBB1YJL199C 327 nt4.08□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 STE23YLR389C 3084 nt4.08□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 CMC4YMR194C-B 222 nt4.08□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 ATG13YPR185W 2217 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 MET5YJR137C 4329 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 OST4YDL232W 111 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 RPL23BYER117W 414 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 RPS28BYLR264W 204 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 snR43snR43 209 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 ROM1YGR070W 3468 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 NOP4YPL043W 2058 nt4.07□□□□□ -1.76
NOP53Q12080 FIG4YNL325C 2640 nt4.07□□□□□ -1.76
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