Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CGNL1Q0VF96 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms