Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms