Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms