Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms