Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN12Q05209 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms