Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNC4Q03721 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms