Protein–RNA interactions for Protein: Q03579

LIP1, Ceramide synthase subunit LIP1, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LIP1Q03579 TDA2YER071C 381 nt0.69□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 ACF4YJR083C 930 nt0.69□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YHC1YLR298C 696 nt0.69□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 RPL9BYNL067W 576 nt0.69□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 IRC23YOR044W 474 nt0.69□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YCL023CYCL023C 348 nt0.69□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 APL3YBL037W 3078 nt0.69□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 PAU2YEL049W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 RPL42BYHR141C 321 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 PAU18YLL064C 363 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 RPS18BYML026C 441 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 SAS3YBL052C 2496 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 RPL42AYNL162W 321 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 PAU6YNR076W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YOR364WYOR364W 369 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 SPT21YMR179W 2277 nt0.68□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 GDS1YOR355W 1569 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 CLU1YMR012W 3834 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YBL062WYBL062W 381 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 RPB11YOL005C 363 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 ATP20YPR020W 348 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 PIP2YOR363C 2991 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 KIP1YBL063W 3336 nt0.67□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YGR130CYGR130C 2451 nt0.66□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.66□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.66□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 ZRG17YNR039C 1818 nt0.66□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 YPR117WYPR117W 7470 nt0.66□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 RPL37AYLR185W 267 nt0.66□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 SWS2YNL081C 432 nt0.66□□□□□ -2.3
LIP1Q03579 NUP145YGL092W 3954 nt0.65□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 NUT1YGL151W 3399 nt0.65□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YCL020WYCL020W 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 SMD3YLR147C 306 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YPL039WYPL039W 951 nt0.64□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 AIM9YER080W 1884 nt0.63□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 PRM8YGL053W 714 nt0.63□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 LIN1YHR156C 1023 nt0.63□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 TMA10YLR327C 261 nt0.63□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YOL106WYOL106W 354 nt0.63□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 VPS52YDR484W 1926 nt0.63□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 SCC2YDR180W 4482 nt0.63□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 VMA7YGR020C 357 nt0.62□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.62□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.62□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 NBP1YLR457C 960 nt0.62□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 HDA3YPR179C 1968 nt0.62□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 RRI2YOL117W 1938 nt0.62□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 REV3YPL167C 4515 nt0.61□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 SAG1YJR004C 1953 nt0.61□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YLR217WYLR217W 324 nt0.61□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 DCP2YNL118C 2913 nt0.61□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 SIP4YJL089W 2490 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 CYC7YEL039C 342 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 SMB1YER029C 591 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YHR054CYHR054C 1065 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YNL150WYNL150W 408 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 ERP4YOR016C 624 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 TOF2YKR010C 2316 nt0.6□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 SRP14YDL092W 441 nt0.59□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 snR79snR79 84 nt0.59□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YGR045CYGR045C 363 nt0.59□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YAP3YHL009C 993 nt0.59□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 SEC28YIL076W 891 nt0.59□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YBR012CYBR012C 420 nt0.59□□□□□ -2.31
LIP1Q03579 YDL073WYDL073W 2955 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 UTP13YLR222C 2454 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 IML1YJR138W 4755 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 NOC3YLR002C 1992 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 NUP157YER105C 4176 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YDL152WYDL152W 366 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 COX7YMR256C 183 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YOP1YPR028W 543 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YPR147CYPR147C 915 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YPR170CYPR170C 336 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 MPT5YGL178W 2580 nt0.58□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YER121WYER121W 345 nt0.57□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 RPL16AYIL133C 600 nt0.57□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 PKR1YMR123W 369 nt0.57□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.57□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 SET3YKR029C 2256 nt0.56□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.56□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 CWC23YGL128C 852 nt0.56□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.56□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YLR255CYLR255C 354 nt0.56□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.56□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 ZIP1YDR285W 2628 nt0.56□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 SWI5YDR146C 2130 nt0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.7 ms