Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms