Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms