Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK3Q00526 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK3Q00526 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms