Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms