Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAMP50895 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAMP50895 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAMP50895 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAMP50895 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAMP50895 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAMP50895 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms