Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF6P49848 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF6P49848 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF6P49848 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF6P49848 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF6P49848 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms