Protein–RNA interactions for Protein: P47098

TY1B-JR1, Transposon Ty1-JR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-JR1P47098 RSM28YDR494W 1086 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-JR1P47098 RTR1YER139C 681 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-JR1P47098 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-JR1P47098 YLL020CYLL020C 306 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-JR1P47098 DUO1YGL061C 744 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-JR1P47098 MVB12YGR206W 306 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-JR1P47098 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-JR1P47098 TSA2YDR453C 591 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 IRC19YLL033W 693 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 RPL9BYNL067W 576 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YHL012WYHL012W 1482 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 HSK3YKL138C-A 210 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 NNF2YGR089W 2811 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YCR090CYCR090C 549 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 TAP42YMR028W 1101 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YMR324CYMR324C 243 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 TEX1YNL253W 1269 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 BMT5YIL096C 1011 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 SST2YLR452C 2097 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 SLS1YLR139C 1932 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 OSH6YKR003W 1347 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 SWF1YDR126W 1011 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 TMA20YER007C-A 546 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YBR012CYBR012C 420 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YOR282WYOR282W 321 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 TRS20YBR254C 528 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 NDD1YOR372C 1665 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 AFR1YDR085C 1863 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 COG7YGL005C 840 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 COX6YHR051W 447 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 LOA1YPR139C 903 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 TOF2YKR010C 2316 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YDL206WYDL206W 2289 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YPD1YDL235C 504 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YLR042CYLR042C 486 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YOL050CYOL050C 321 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 NUT2YPR168W 474 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 MUD2YKL074C 1584 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YHR212CYHR212C 336 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 SDL1YIL167W 633 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 RCN1YKL159C 636 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YAR060CYAR060C 336 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 PGA1YNL158W 597 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-JR1P47098 YCR043CYCR043C 384 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 VIK1YPL253C 1944 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YDR509WYDR509W 348 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 POP8YBL018C 402 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 IZH4YOL101C 939 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YLR225CYLR225C 1224 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 SLI15YBR156C 2097 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 NUR1YDL089W 1455 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 RPC25YKL144C 639 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YML047W-AYML047W-A 366 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YPL034WYPL034W 498 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 MPT5YGL178W 2580 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 RPL35BYDL136W 363 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 CYC7YEL039C 342 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 NBP1YLR457C 960 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 CGI121YML036W 546 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 RPL32YBL092W 393 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 MKT1YNL085W 2493 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 GIC2YDR309C 1152 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 GRX8YLR364W 330 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 SEC5YDR166C 2916 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 PIG1YLR273C 1947 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YJR071WYJR071W 369 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 ATX1YNL259C 222 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-JR1P47098 GPX2YBR244W 489 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 SLM6YBR266C 453 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YJL049WYJL049W 1353 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 VPS74YDR372C 1038 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 AIM41YOR215C 558 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 HAL9YOL089C 3093 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 PXA2YKL188C 2562 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 RPL35AYDL191W 363 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 IMP3YHR148W 552 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YOL150CYOL150C 312 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 DBP6YNR038W 1890 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YAL069WYAL069W 315 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 snR190snR190 190 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 ISD11YER048W-A 285 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YGR219WYGR219W 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 snR63snR63 255 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 HYM1YKL189W 1200 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 RPL37AYLR185W 267 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YNR021WYNR021W 1215 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 RPB10YOR210W 213 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-JR1P47098 NIP100YPL174C 2607 nt-0.08□□□□□ -2.42
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