Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRKP46108 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRKP46108 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRKP46108 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRKP46108 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRKP46108 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRKP46108 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRKP46108 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRKP46108 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRKP46108 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRKP46108 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRKP46108 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRKP46108 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRKP46108 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms