Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSBP45954 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSBP45954 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSBP45954 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms